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The Gateway to the Brain: Dissecting the Primate Eye

The visual system in humans is considered the  gateway  to the world and plays a principal role in the plethora of sensory, perceptual and cognitive ...

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Knowing What Counts: Unbiased Stereology in the Non-human Primate Brain

The non-human primate is an important translational species for understanding the normal function and disease processes of the human brain. Unbiased ...

The aim of this study was to develop new nonoperative strategies for the management of meconium ileus in an attempt to improve on the current unacceptable failure rate.

New strategies in nonoperative management of meconium ileus.

Neue Strategien in operatives Management von Mekoniumileus.

The Ravitch repair of pectus excavatum removes segments of abnormal costal cartilages after which the sternum is elevated and stabilized. Some investigators have found a worsening in total lung capacity postoperatively. Recently, a technique has been used in which the costal cartilages are preserved, and the sternum is elevated with an internal steel bar (Nuss repair). The authors hypothesized that placement of a substernal bar in the first stage of the Nuss repair will not adversely affect pulmonary and exercise function.

Pulmonary function and exercise response in patients with pectus excavatum after Nuss repair.

Lungenfunktion und &#xDC;bung kann bei Patienten mit Trichterbrust nach Nuss Reparatur.

Sequencing of EST and BAC end datasets is no longer limited to large research groups. Drops in per-base pricing have made high throughput sequencing accessible to individual investigators. However, there are few options available which provide a free and user-friendly solution to the BLAST result storage and data mining needs of biologists.

Alkahest NuclearBLAST : a user-friendly BLAST management and analysis system.

Alkahest NuclearBLAST: ein benutzerfreundliches BLAST-Management und-Analyse-System.

Pasteuria penetrans is a gram-positive, endospore-forming eubacterium that apparently is a member of the Bacillus-Clostridium clade. It is an obligate parasite of root knot nematodes (Meloidogyne spp.) and preferentially grows on the developing ovaries, inhibiting reproduction. Root knot nematodes are devastating root pests of economically important crop plants and are difficult to control. Consequently, P. penetrans has long been recognized as a potential biocontrol agent for root knot nematodes, but the fastidious life cycle and the obligate nature of parasitism have inhibited progress on mass culture and deployment. We are currently sequencing the genome of the Pasteuria bacterium and have performed amino acid level analyses of 33 bacterial species (including P. penetrans) using concatenation of 40 housekeeping genes, with and without insertions/deletions (indels) removed, and using each gene individually. By application of maximum-likelihood, maximum-parsimony, and Bayesian methods to the resulting data sets, P. penetrans was found to cluster tightly, with a high level of confidence, in the Bacillus class of the gram-positive, low-G+C-content eubacteria. Strikingly, our analyses identified P. penetrans as ancestral to Bacillus spp. Additionally, all analyses revealed that P. penetrans is surprisingly more closely related to the saprophytic extremophile Bacillus haladurans and Bacillus subtilis than to the pathogenic species Bacillus anthracis and Bacillus cereus. Collectively, these findings strongly imply that P. penetrans is an ancient member of the Bacillus group. We suggest that P. penetrans may have evolved from an ancient symbiotic bacterial associate of nematodes, possibly as the root knot nematode evolved to be a highly specialized parasite of plants.

Phylogenetic analysis of Pasteuria penetrans by use of multiple genetic loci.

Phylogenetische Analyse von Pasteuria penetrans unter Verwendung von multiplen genetischen Loci.

The impact of cataract (which frequently occurs alongside glaucoma) on scanning laser tomography (SLT) is poorly understood. The aim of this pilot study was to determine the impact of artificial light scatter on SLT estimates of optic nerve head (ONH) topography.

The impact of artificial light scatter on scanning laser tomography.

Die Auswirkungen der Katarakt (die h&auml;ufig neben Glaukom auftritt) auf scanning-Laser-Tomographie (SLT) wird oft missverstanden. Ziel dieser Pilotstudie war die Auswirkung der k&uuml;nstlichen Lichtstreuung SLT Sch&auml;tzungen der Sehnerv Kopf (ONH) Topographie bestimmen.

Die Auswirkungen der k&uuml;nstlichen Lichtstreuung auf scanning-Laser-Tomographie.

Ventilator-associated pneumonia (VAP) is diagnosed in about 30% to 50% of critically ill postsurgical and trauma patients. Early appropriate antibiotic therapy has been associated with improved survival rates. The diagnosis, however, continues to be a challenge. We routinely employ clinical pulmonary infection scores to warrant a bronchoalveolar lavage (BAL) quantitative culture to subsequently diagnose VAP. Presumptive antibiotic therapy for the first 48 to 72 hours is based on the sputum Gram stain, obtained at the time of BAL. This study was conducted to analyze the predictive value of sputum Gram stain for selecting appropriate early antibiotic therapy for VAP as confirmed by a BAL quantitative culture (>10 CFU/mL considered diagnostic).

Predictive value of sputum gram stain for the determination of appropriate antibiotic therapy in ventilator-associated pneumonia.

Ventilator-assoziierten Pneumonie (VAP) ist in etwa 30 bis 50 % von kritisch kranken postsurgical und Trauma-Patienten diagnostiziert. Fr&uuml;her geeigneter Antibiotika-Therapie wurde verbesserte &Uuml;berlebensraten zugeordnet. Die Diagnose jedoch weiterhin eine Herausforderung sein. Wir besch&auml;ftigen regelm&auml;&szlig;ig klinische pulmonale Infektion Resultate zu rechtfertigen eine Bronchoalveol&auml;re Lavage (BAL) quantitativen Kultur VAP nachtr&auml;glich zu diagnostizieren. Vermutliche Antibiotika-Therapie f&uuml;r die ersten 48 bis 72 Stunden basiert auf Sputum Gramm-Fleck, zum Zeitpunkt der BAL gewonnen. Diese Studie wurde durchgef&uuml;hrt, um den Vorhersagewert Sputum Gramm-Fleck zum Ausw&auml;hlen von geeigneten fr&uuml;hen antibiotischen Therapie f&uuml;r VAP durch eine quantitative BAL-Kultur best&auml;tigt analysieren (&gt; 10 KBE/mL als Diagnose betrachtet).

Vorhersagewert von Auswurf Gram stain zur Bestimmung der geeigneten Antibiotika-Therapie in der Ventilator-assoziierten Pneumonie.

Case presentation and literature review for intestinal malrotation presenting in an adult. Although the number of patients with this condition that escape infancy undiagnosed is not clear, it is clear that when the rare patient presents as an adult it can be a perplexing situation for surgeons not familiar with the presenting signs and anatomy. This confusion can lead to diagnostic and intraoperative errors.

Gastrointestinal malrotation with volvulus in an adult.

RS Pr&auml;sentation und Literatur Bewertung Malrotation des Darmes in einem Erwachsenen zu pr&auml;sentieren. Obwohl die Zahl der Patienten mit dieser Bedingung, die Kindheit undiagnosed entgehen nicht klar ist, ist es klar, dass wenn der seltene Patient pr&auml;sentiert sich als Erwachsener eine best&uuml;rzende Situation f&uuml;r Chirurgen nicht vertraut mit der pr&auml;sentierende Zeichen und Anatomie sein kann. Diese Verwirrung kann zu diagnostischen und intraoperative St&ouml;rungen f&uuml;hren.

Gastro-intestinale Malrotation mit Volvulus bei einem Erwachsenen.

We have established Meloidogyne hapla as a tractable model plant-parasitic nematode amenable to forward and reverse genetics, and we present a complete genome sequence. At 54 Mbp, M. hapla represents not only the smallest nematode genome yet completed, but also the smallest metazoan, and defines a platform to elucidate mechanisms of parasitism by what is the largest uncontrolled group of plant pathogens worldwide. The M. hapla genome encodes significantly fewer genes than does the free-living nematode Caenorhabditis elegans (most notably through a reduction of odorant receptors and other gene families), yet it has acquired horizontally from other kingdoms numerous genes suspected to be involved in adaptations to parasitism. In some cases, amplification and tandem duplication have occurred with genes suspected of being acquired horizontally and involved in parasitism of plants. Although M. hapla and C. elegans diverged >500 million years ago, many developmental and biochemical pathways, including those for dauer formation and RNAi, are conserved. Although overall genome organization is not conserved, there are areas of microsynteny that may suggest a primary biological function in nematodes for those genes in these areas. This sequence and map represent a wealth of biological information on both the nature of nematode parasitism of plants and its evolution.

Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism.

Wir haben Meloidogyne Hapla als eine beeinflussende Modell Pflanze parasitische Fadenw&uuml;rmer geneigt sein, Forward- und reverse Genetik etabliert und pr&auml;sentieren wir Ihnen eine vollst&auml;ndige Genom-Sequenz. Bei 54 Mbp M. Hapla stellt nicht nur das kleinste Fadenw&uuml;rmer Genom noch abgeschlossen, aber auch die kleinsten Bilateria, und definiert eine Plattform, um die Mechanismen der Parasitismus von was die gr&ouml;&szlig;te unkontrollierte Gruppe von pflanzlichen Krankheitserregern weltweit ist zu erhellen. M. Hapla Genom kodiert deutlich weniger Gene als die freilebenden Fadenwurm Caenorhabditis Elegans (vor allem durch eine Reduktion der Odoriermittel Rezeptoren und anderen gen-Familien), nicht aber sie horizontal aus anderen K&ouml;nigreichen zahlreiche Gene, die Anpassungen an den Parasitismus beteiligt sein k&ouml;nnten, erworben hat. In einigen F&auml;llen traten Verst&auml;rkung und Tandem-Duplikation mit Genen der &uuml;bertragenden horizontal verd&auml;chtigt und Parasitismus der Pflanzen beteiligt. Obwohl M. Hapla und C. Elegans auseinandergelaufen &gt; vor 500 Millionen Jahren viele Entwicklungs- und biochemische Bahnen, auch f&uuml;r Dauer-Bildung und RNAi, sind konserviert. Obwohl Gesamt-Genom-Organisation nicht erhalten ist, gibt es Bereiche des Microsynteny, der eine prim&auml;re biologische Funktion in Nematoden f&uuml;r diese Gene in diesen Bereichen vorschlagen kann. Diese Sequenz und Karte repr&auml;sentieren eine F&uuml;lle von biologischen Informationen &uuml;ber die Art der Fadenwurm Parasitismus der Pflanzen und ihrer Entwicklung.

Sequenz und genetischen Karte von Meloidogyne Hapla: eine kompakte Fadenwurm Genom f&uuml;r Pflanze Parasitismus.

Children with fetal alcohol spectrum disorders (FASD) show behavioral and intellectual impairments that indicate frontal lobe dysfunction, but the extent of damage to this region has not been clarified by brain imaging studies. This study uses the St Kitts vervet monkey, a species that voluntarily consumes beverage alcohol, to examine the effects of prenatal ethanol exposure. Pregnant vervets were allowed to drink the equivalent of 3-5 standard drinks four times a week during the third trimester. Using unbiased stereology, we estimated neuronal reduction and found significantly fewer cells in the frontal lobes of FASD offspring as well as an increased density of interstitial white matter neurons. These cytoarchitectonic effects are consistent with the behavioral and cognitive changes observed in FASD.

Neuronal reduction in frontal cortex of primates after prenatal alcohol exposure.

Kinder mit fetalen Alkohol-Spektrum-St&ouml;rungen (FASD) zeigen Verhaltens- und geistigen Beeintr&auml;chtigungen, die Frontallappen-Dysfunktion hinweisen, aber das Ausma&szlig; der Sch&auml;den in dieser Region hat von Brain imaging Studien nicht gekl&auml;rt. Diese Studie verwendet St Kitts Gr&uuml;nmeerkatze, eine Spezies, die freiwillig Trinkalkohol, um die Auswirkungen der pr&auml;natalen &Auml;thanol Exposition untersuchen verbraucht. Schwangere Vervets durften den Gegenwert von 3-5-standard-Getr&auml;nke vier dreimal pro Woche w&auml;hrend des dritten Trimesters zu trinken. Verwenden unvoreingenommene Stereologie, wir gesch&auml;tzt neuronale Reduktion und deutlich weniger Zellen in die Frontal lobes der FASD Nachkommen sowie eine erh&ouml;hte Dichte interstitielle wei&szlig;en Substanz Neuronen gefunden. Diese cytoarchitektonische-Effekte sind konsistent mit den Verhaltens- und kognitiven Ver&auml;nderungen bei FASD beobachtet.

Neuronale Reduzierung im frontalen Kortex der Primaten nach pr&auml;nataler Alkohol Exposition.

Hemiparesis, unilateral weakness or partial paralysis, is a common outcome following hemispherectomy in humans. We use the non-human primate as an invaluable translational model for our understanding of developmental plasticity in response to hemispherectomy. Three infant vervet monkeys (Chlorocebus sabeus) underwent hemispherectomy at a median age of 9 weeks and two additional monkeys at 48 months. Gross motor assessment was conducted in a large open field that contained a horizontal bar spanning the width of the cage. Subjects were assessed yearly following surgery in infantile lesions for a period of 3 years. Adult-lesioned subjects were assessed 40 months following surgery. Shortly after surgery both infant and adult-lesioned subjects were unable to move the contralateral side of their body, but all subjects were able to walk within 6 months following surgery. At each time point the lower limb gait was normal in infant-lesioned subjects with no apparent limp or dragging, however the upper limb demonstrated significant impairment. Horizontal bar crossing was significantly impaired during the first 24 months following surgery. Adult-lesioned subjects also displayed upper limb movement impairments similar to infant-lesioned subjects. In addition the adult-lesioned subjects displayed a noticeable lower limb limp, which was not observed in the infant-lesioned group. Both groups at each time point showed a propensity for ipsiversive turning. The upper limb gait impairment and horizontal bar crossing of lesioned subjects are reminiscent of hemiparesis seen in hemisperectomized humans with the young-lesioned subjects showing a greater propensity for recovery.

Partial recovery of hemiparesis following hemispherectomy in infant monkeys.

Hemiparese, einseitige Schw&auml;che oder teilweise L&auml;hmung, ist ein h&auml;ufiges Ergebnis nach Hemispherectomy beim Menschen. Wir verwenden die nichtmenschlichen Primaten als unsch&auml;tzbare translational Modell f&uuml;r unser Verst&auml;ndnis von Entwicklungsst&ouml;rungen Plastizit&auml;t als Reaktion auf Hemispherectomy. Drei Kleinkinder Vervet Affen (Chlorocebus Sabeus) wurde Hemispherectomy auf ein Durchschnittsalter von 9 Wochen und zwei weitere Affen auf 48 Monate. Brutto motor Bewertung wurde in einem gro&szlig;en offenen Feld durchgef&uuml;hrt, die eine horizontale bar auf die Breite des K&auml;figs enthalten. Bewertet j&auml;hrlich nach der Operation in infantile L&auml;sionen wurden f&uuml;r einen Zeitraum von 3 Jahren. Erwachsenen-lesioned wurden beurteilten 40 Monate nach der Operation. Kurz nach der Operation waren sowohl f&uuml;r Kleinkinder als auch f&uuml;r Erwachsene-lesioned Themen nicht die kontralaterale Seite ihres K&ouml;rpers zu bewegen, aber alle Themen waren in der Lage, innerhalb von 6 Monaten nach der Operation zu gehen. Zu jedem Zeitpunkt der untere Extremit&auml;t-Gang war normal in Kleinkind-lesioned F&auml;chern mit keine offensichtlichen hinken oder ziehen, aber der oberen Extremit&auml;t gezeigt wesentlichen Beeintr&auml;chtigung. Horizontal bar Kreuzung war in den ersten 24 Monaten nach der Operation deutlich beeintr&auml;chtigt. Erwachsenen-lesioned Themen angezeigt auch oberen Gliedma&szlig;en Bewegung Beeintr&auml;chtigungen &auml;hnlich dem Kleinkind-lesioned Themen. Dar&uuml;ber hinaus angezeigt die Erwachsenen-lesioned Themen eine sp&uuml;rbare untere Extremit&auml;t schlaff, die nicht in der S&auml;uglings-lesioned Gruppe beobachtet wurde. Beide Gruppen zu jedem Zeitpunkt zeigte eine Neigung f&uuml;r Ipsiversive drehen. Die oberen Gliedma&szlig;en Gang Wertminderung und Horizontal bar &Uuml;berquerung des lesioned Themen erinnern die Hemiparese mit den jungen-lesioned Themen zeigen eine gr&ouml;&szlig;ere Neigung zur Verwertung in Hemisperectomized Menschen gesehen.

Teilweise Wiederherstellung der Hemiparese nach Hemispherectomy bei Kleinkinder Affen.

Cholinergic and dopaminergic projections to the rat medial prefrontal cortex (mPFC) are both involved in cognitive functions including attention. These neuronal systems modulate mPFC neuronal activity mainly through diffuse transmission. In order to better understand the anatomical level of influence of these systems, confocal microscopy with triple-fluorescent immunolabeling was used in three subregions of the mPFC of rats and Drd1a-tdTomato/Drd2-EGFP transgenic mice. The zone of interaction was defined as a reciprocal microproximity between dopaminergic and cholinergic axonal segments as well as pyramidal neurons. The density of varicosities, along these segments was considered as a possible activity-dependant morphological feature. The percentage of cholinergic and dopaminergic fibers in microproximity ranged from 12 to 40% depending on the layer and mPFC subregion. The cholinergic system appeared to have more influence on dopaminergic fibers since a larger proportion of the dopaminergic fibers were within microproximity to cholinergic fibers. The density of both cholinergic and dopaminergic varicosities was significantly elevated within microproximities. The main results indicate that the cholinergic and dopaminergic systems converge on pyramidal cells in mPFC particularly in the layer V. In transgenic mice 93% of the pyramidal cells expressed the transgenic marker for Drd2 expression, but only 22% expressed the maker for Drd1ar expression. Data presented here suggest that the modulation of mPFC by dopaminergic fibers would be mostly inhibitory and localized at the output level whereas the cholinergic modulation would be exerted at the input and output level both through direct interaction with pyramidal cells and dopaminergic fibers.

Confocal Analysis of Cholinergic and Dopaminergic Inputs onto Pyramidal Cells in the Prefrontal Cortex of Rodents.

Cholinergic und dopaminergen Projektionen f&uuml;r die Ratte medialen pr&auml;frontalen Kortex (mPFC) sind beide kognitive Funktionen einschlie&szlig;lich Aufmerksamkeit beteiligt. Diese neuronale Systeme modulieren mPFC neuronale Aktivit&auml;t vor allem durch diffuse &Uuml;bertragung. Um die anatomische Ebene der Einfluss dieser Systeme besser zu verstehen, wurde confocal Mikroskopie mit Dreifach-fluoreszierender Immunolabeling in drei Subregionen von mPFC des Drd1a-TdTomato/Drd2-EGFP transgene M&auml;use und Ratten verwendet. Die Zone der Interaktion war definiert als eine gegenseitige Microproximity zwischen dopaminergen und cholinergen axonale Segmente sowie pyramidenf&ouml;rmigen Nervenzellen. Die Dichte der Varikosis, entlang dieser Segmente galt als eine m&ouml;gliche T&auml;tigkeit-abh&auml;ngige morphologischen Funktion. Der Prozentsatz der cholinergen und dopaminergen Fasern in Microproximity lag zwischen 12 und 40 % je nach der Schicht und mPFC Subregion. Das cholinerge System erschien, mehr Einfluss auf dopaminerge Fasern zu haben, da ein gr&ouml;&szlig;erer Teil der dopaminergen Fasern waren innerhalb Microproximity cholinerge Fasern. Die Dichte der beiden cholinerge und dopaminergen Varikose wurde innerhalb der Microproximities deutlich erh&ouml;ht. Die wichtigsten Ergebnisse zeigen, dass die cholinerge und dopaminergen Systeme auf Pyramidenzellen in mPFC besonders in der Schicht V zusammenlaufen. In transgenen M&auml;usen ausgedr&uuml;ckt 93 % der die Pyramidenzellen den transgenen Marker f&uuml;r Drd2 Ausdruck, aber nur 22 % ausgedr&uuml;ckt des Herstellers f&uuml;r Drd1ar Ausdruck. Hier vorgestellte Daten schlagen vor, da&szlig; die Modulation von mPFC durch dopaminerge Fasern meist hemmenden w&auml;re und auf der Ausgabeebene lokalisiert, w&auml;hrend die cholinerge Modulation auf der Input- und Output-Ebene ausge&uuml;bt werden w&uuml;rde sowohl durch direkte Interaktion mit Pyramidenzellen und dopaminergen Fasern.

ArticleTotal : 2	Year
Publication title Cited by 7	2009
Publication title Cited by 22	2009

Article	Year
New strategies in nonoperative management of meconium ileus. Journal of pediatric surgery\| PubMed ID: 11987095	2002
Pulmonary function and exercise response in patients with pectus excavatum after Nuss repair. Journal of pediatric surgery\| PubMed ID: 12677562	2003
Alkahest NuclearBLAST : a user-friendly BLAST management and analysis system. BMC bioinformatics\| PubMed ID: 15958161	2005
Phylogenetic analysis of Pasteuria penetrans by use of multiple genetic loci. Journal of bacteriology\| PubMed ID: 16077116	2005
The impact of artificial light scatter on scanning laser tomography. Optometry and vision science : official publication of the American Academy of Optometry\| PubMed ID: 16614577	2006
Predictive value of sputum gram stain for the determination of appropriate antibiotic therapy in ventilator-associated pneumonia. The Journal of trauma\| PubMed ID: 17563652	2007
Gastrointestinal malrotation with volvulus in an adult. American journal of surgery\| PubMed ID: 18304508	2008
Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America\| PubMed ID: 18809916	2008
Neuronal reduction in frontal cortex of primates after prenatal alcohol exposure. Neuroreport\| PubMed ID: 18987558	2009
Partial recovery of hemiparesis following hemispherectomy in infant monkeys. Neuroscience letters\| PubMed ID: 19969043	2010
Confocal Analysis of Cholinergic and Dopaminergic Inputs onto Pyramidal Cells in the Prefrontal Cortex of Rodents. Frontiers in neuroanatomy\| PubMed ID: 20589096	2010

Mark Burke

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